在《河套深港科技創新合作區香港園區發展綱要》中，強調香港園區的規劃和設計不僅要符合技術創新的需求，更要秉持環境、社會和管治（ESG）理念，並推動綠色及低碳發展理念。然而，隨著園區規模的擴大，首期樓宇的最高樓層從最初限制的10層，調整至不超過40層，引發社會各界的熱烈討論及關注。
創新科技及工業局局長孫東在接受《星島》訪問時，闡明了此一調整背後的考量。他指出，設計樓高的過程中，已充分考慮到生態保護的重要性，特別是鳥類飛行路徑的影響。其中，位於園區最南端的人才公寓樓高仍限制在2層，目的在於保護雀鳥的自然飛行路徑。他強調，這些做法不僅是為了遵守環保相關的法律規範，還是為了確保整個建設過程中顧及生態系統的完整性，以避免對自然保護區造成影響。他表示，「綠色生態保護的理念已完備考量，否則在城規上就會過不了關。」
隨著第一期園區工程的攪動，孫東透露預計在明年啟用之際，將會吸引首批千人進駐。園區的總樓面面積達到100萬平方米，幾乎等同於原計劃中的兩期發展面積。由於第一期大幅度提升樓面面積的需求，為了加速發展，第二期的用地規劃需要重新評估。孫東坦言，現階段第二期的用地，包括計劃在應急醫院舊址上建設現代化醫學大樓，其餘部分仍在進行初步規劃。他表示，「不特別細化的方案是出於戰略留白，預期2027年後內地政府也會迅速確定第二期的發展細節。」
在園區開放的初期，主要的進出方式將依賴落馬洲口岸的通行。為了應對人員流動，會設有特殊通道，確保特定的內地人員能夠用專車方便快捷地前往園區，而香港居民則需在特定站點登車進入。這樣的安排需要與保安局、運輸及物流局進一步協調。他提及，園區在《綱要》中提出積極探討保留內地籍人員的社會福利保障，
也透露香港居民赴深圳工作不會影響到他們在香港的福利，這是為了減輕內地人員的後顧之憂，期望能吸引更多人才加入園區的工作行列，進一步推動科技創新與經濟發展的雙贏局面。
