由於管理問題，孔教學院宣布將於2025至2026學年停止大成小學小一新生入學，並計劃在2026至2027學年結束學校運營。教育局決定介入，委任新校董進駐法團校董會，積極協助改善學校管理。
面對學校的停辦通知，教育局重申已多次與學校管理層及辦學團體進行深入溝通，強調必須以學生福祉為首要考慮，並詳細計劃學生的過渡安排。然而，雙方未能在討論中達成一致意見，導致管理層面的瓶頸。
為了確保學生的學習權益不受影響，根據《教育條例》，教育局將派出委任校董，協助校董會更好地履行職責，確保學校管理的有效性及學生教育質量。
另一方面，校長袁潘淑嫻與法團校董會成員於記者會上呼籲孔教學院重新考慮停辦決策，並要求擴大諮詢範圍。袁校長批評孔教學院的決策過程忽視了教育局長期倡導的學校治理原則，僅從財政角度考量，未充分尊重學校和持份者的意見。
學校在未獲新小一生入學的情況下，由學校發展基金自籌經費開設私家班，以繼續教育服務。此舉展示了學校對教育承諾的堅持。
對此，孔教學院回應表示，已與多個教育團體接洽，探討未來合作可能，並將持續與家長和教職員保持開放的溝通，以確保學生能順利過渡到其他學校。
