台灣的音樂治療雖然已有數十年的發展歷史，卻因為醫療法規的限制，未能成為政府認證的醫事人員，這使得音樂治療師在執行治療行為時必須依賴其他醫事人員的合作。台灣音樂治療學會的理事長吳佳慧指出，儘管政府對音樂治療持肯定態度，提供例如兒童早療的音樂治療補助，但由於音樂治療師缺乏官方認證，常常需要與其他專業人士合作才能進行治療，這形成了一個限制音樂治療發展的瓶頸。
音樂治療在台灣的推動始於近30年前，最初的專業人才大多在國外受訓並獲得認證。2015年，輔仁大學開設了音樂治療碩士在職專班，這標誌著本土人才培養的開始，隨後東海大學、屏東大學等院校也相繼開設相關課程。儘管這些進展帶來了希望，但法規的限制仍是一大挑戰。根據現行法律，僅有經認證的醫事人員才能進行治療，而音樂治療師不在此列。
吳佳慧透露，她曾向前副總統陳建仁提出音樂治療師的工作權問題，希望能有立法支持音樂治療師的專業認證。音樂治療學會的另一位理事鄭棋怡也表示，他們不僅在推動音樂治療的專業認證立法，也在努力將藝術治療、舞蹈動作治療、戲劇治療及心理劇等相關領域納入專業認證範疇。
目前台灣約有67名音樂治療師，他們通過實習和認證逐步獲得專業認可。吳佳慧強調，儘管有了一定的進展，音樂治療在台灣仍然屬於自費項目，治療費用因場合不同而有所差異。衛福部醫事司長劉越萍則指出，音樂治療目前被視為一種輔助療法，並未正式納入醫事人員的範疇，這也反映了對此療法的法律認知及實踐上的諸多限制。
