隨著《河套深港科技創新合作區香港園區發展綱要》的推進，植根於绿色和低碳理念的香港園區，正在接受重新規劃與設計的挑戰。根據創新科技及工業局局長孫東的說明，第一期的發展將樓層限制從最初的10層提高至最高40層，這一變革引發了公眾及環保團體的熱議。許多批評者指出，這一改變與早前對於鳥類飛行路徑的保護計劃存在矛盾。
然而，孫東強調在樓高設計過程中，生態保護的重要性得到了充分考量。即使是在南端的人才公寓，樓高仍然被限制在2層，以確保不妨礙雀鳥的飛行路徑。他指出，這些措施都是為了維護自然生態環境，並確保在規劃過程中不觸及任何自然保護區。孫東明言，「綠色生態保護的理念完全融入到整個規劃之中，這樣才能夠順利通過城市規劃的審查。」
面對樓面面積的擴大，第一期園區的總樓面面積已經增加至100萬平方米，這一數字幾乎達到之前規劃的兩期園區的總面積。孫東坦言，為了加速發展，目前的計劃是將一些第二期的開發規模提前到第一期來實現，因此相關的城市規劃需要重新進行修訂。他透露，第二期的主要建設將是在應急醫院原址上建設一座現代化醫學大樓，此外還有其他用地的初步規劃。對於為何不詳細規劃，孫東解釋這是出於「戰略留白」，他相信在2027年之後，內地政府也會力求明確第二期的發展方向。
孫東預計，第一期園區在明年開始啟用後，將會吸引約千名專業人士進駐，目前已有數十家潛在租戶在洽談當中，對於生命健康科技的企業表現出極高的興趣。在開放初期，內地人員主要將透過落馬洲口岸進入園區，屆時會設有特殊通道安排，確保特定人員能夠專車前往；同時，香港居民則需要在特定的站點上車進入。
孫東也提到，關於《綱要》中討論的內地籍人員在社會福利保障方面的問題，他表示，香港人員前往深圳工作將不會影響他們在香港的福利，這樣的安排將為吸引內地人才進入園區工作鋪平道路，使其能夠專注於工作，無需擔心其他后顧之憂。這一系列的措施旨在確保香港園區不僅能滿足發展需求，還能兼顧到生態和社會的可持續發展目標。
