在《河套深港科技創新合作區香港園區發展綱要》中，明確提出香港園區在未來的規劃與設計中，將堅持環境、社會及管治（ESG）原則，致力於綠色和低碳的發展理念。然而，隨著第一期樓宇的總樓面面積大幅增加，樓層高度的上限也從最初的10層調升至40層，這一變更引起了社會的廣泛關注。
針對環保團體對此變動的質疑，孫東，創新科技及工業局局長，在接受《星島》專訪時強調，在樓高設計的過程中，生態保護的因素並未被忽視。他提到，設計中考慮了多種環境保護要素，例如位於園區最南端的人才公寓仍然限制在2層，明確是為了保護該地區的鳥類飛行路徑。他指出：“我們在設計和規劃的時候，始終將綠色生態保護放在首位，這樣的設計才能符合城市規劃的要求。”根據他的說法，這項措施不僅是對鳥類生態的保護，也確保不會破壞周邊的自然保護區。
第一期園區預計於明年啟用，孫東透露，預計將有約千人進駐此區域。目前，有數十間潛在的租戶與近百間企業正在洽談，絕大多數均為生命健康科技相關企業。隨著園區的開放，內地人員主要依靠落馬洲口岸過境，屆時將會有針對特定人員的特殊通道安排，確保他們能方便地前往園區。香港的員工則需要在特定的上車點乘車進入園區，具體的運作細節將與保安局及運輸及物流局進一步對接和確認。
關於第二期的發展計劃，孫東表示，隨著第一期總樓面面積增至100萬平方米，幾乎達到原定雙期開發的總面積，因此迫使他們將第二期的發展規模移至第一期。他指出，由於目前的規劃仍處於初步階段，第二期的發展將需要重新進行城市規劃。其中，第一期的現代化醫學大樓計劃在應急醫院舊址上建設，其他用地則尚未具體化，但孫東強調，這些不特定的計劃是出於戰略考量。
孫東對於保留內地籍人員在內地社會保障的討論表示，香港人員往返深圳工作的分配不會影響其在香港的福利，他希望在此安排下，內地的工作人員能夠無後顧之憂，更有效地吸引優秀人才進入園區，助力創新科技的發展。
整體而言，儘管存在諸多挑戰與批評，孫東及其團隊正在嘗試在快速發展的需求與環境保護之間找到平衡點，為未來的科技創新打下堅實的基礎。
