隨著《河套深港科技創新合作區香港園區發展綱要》的推進，香港園區的設計、企業引進以及管理方式都將圍繞環境、社會和管治（ESG）三大核心理念展開，特別強調綠色和低碳的建設理念。此次新規則的主要變化之一便是第一期新增的樓面面積與樓層高度調整，最高樓層的放寬至40層，相較於原先的10層大幅提升。
針對環保團體對於這一調整的批評，創新科技及工業局局長孫東在接受《星島》專訪時表示，縱然樓高得到放寬，設計時的環境保護考量依然是重中之重。他強調，在第一期的布局中，包括最南端的人才公寓仍然設有兩層高度限制，這是為了保護雀鳥的飛行路徑，確保生態環境的和諧，並且避免對周圍自然保護區造成影響。“所有綠色生態保護的因素都已經納入考量，這是我們在規劃上必須遵循的原則。”孫東補充道。
在即將啟用的第一期園區內，總樓面面積已擴大至100萬平方米，這一數據幾乎與原規劃的兩期全面開發後的總樓面面積相等。為了加速發展，團隊決定將第二期的一部分規劃整合至第一期，這意味著第二期的發展需要重新進行城市規劃。除了在應急醫院的原址上計劃建立現代化醫學大樓外，目前還有關於其他用地初步的規劃方案，孫東提到不具體細化的原因是出於「戰略留白」，他相信到2027年，內地政府也會希望能更快確定第二期的發展藍圖。
孫東也透露，第一期園區預計在明年啟用的初期，將會有超過千人進駐，並且已經有多家潛在租戶進行洽談，其中大部分都是來自生命健康科技領域的企業。為了確保園區的運行，園區開放初期，內地人員主要將透過落馬洲口岸入境，屆時會設有特殊通道，以便特定人員能以專車直達園區，而香港人員則需要在特定車站登車入園，具體安排仍需與相關部門進行進一步對接。
針對《綱要》中提到的積極探索保留內地籍人員在內地社會福利保障的問題，孫東表示，香港人員前往深圳工作不會影響他們在香港的福利，因此期望能對內地人員提供相應的保障安排，減少他們的顧慮，吸引更多人才聚集於園區，共同推動區域的科技與經濟發展。這一系列的安排不僅展現了對生態的重視，也為香港及內地的科技創新合作樹立了新的標杆。
