在《河套深港科技創新合作區香港園區發展綱要》中，香港園區的規劃設計以及企業引進管理將堅持環境、社會及管治（ESG）的原則，同時遵循綠色和低碳的理念。然而，隨著總樓面面積的顯著增長，原本限制不超過10層的第一期樓宇計劃已調整至最高可達40層，這一變化引發了廣泛的關注與討論。
針對環保團體的批評，創新科技及工業局局長孫東強調，在調整樓高的過程中充分考慮了生態保護因素。例如，在最南端的人才公寓設計上仍限制在2層，以最大限度地考量鳥類的飛行路徑，避免對當地生態造成影響，他表示：「我們在建築設計上非常謹慎，確保不會觸犯自然保護區的規定。綠色生態的保護理念貫徹始終。為了能夠通過城市規劃的審批，這些考慮是必要的。」
據悉，第一期園區計劃於明年啟用，預計將首批迎來約千人進駐。孫東指出，目前已經有數十間企業表達租用意向，總數近百間，這些企業主要集中在生命健康科技領域，反映出此類產業在香港乃至整個科技創新區的發展潛力。在園區開放初期，內地人員將主要通過落馬洲口岸過境，屆時也將設置特定通道，方便特定人員搭乘專車前往園區，而香港人員需要在指定的上車地點進入園區，具體的安排仍需與保安局及運輸和物流局進一步協商。
此外，對於《綱要》中提到的積極探討保留內地籍人員在內地的社會福利保障，孫東闡述道，香港人員在深圳工作不會影響他們在香港的福利，他期待能為內地人員提供相應的保障措施，以減少他們的「後顧之憂」，從而吸引更多人才加入園區的發展。
然而，由於第一期園區的總樓面面積已經擴增至100萬平方米，幾乎與原規劃的兩期項目總面積相當，孫東表示，為了加快項目進程，第二期的發展需重新進行城市規劃。目前，第二期主要計劃在應急醫院的原址上建立現代化醫學大樓，其他用地也在持續詳細探討中。他提到「戰略留白」的概念，表示相信內地政府會在2027年之後儘快確保第二期的發展計劃。
隨著科技創新合作區的蓬勃發展，孫東的願景十分明確：不僅希望能打造出一個充滿活力與創新的科技生態系統，也要在擴展經濟的同時，維護和促進良好的環境和生態保護，為香港與內地的科技合作開辟新的可能。
